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España obtiene por primera vez la secuencia del genoma de una especie superior

Un grupo de investigadores españoles ha obtenido el primer borrador de la secuencia del genoma de melón en el marco del proyecto MELONOMICS, financiado por Genoma España

Madrid - 02. November 2009

El borrador de la secuencia del genoma del melón abarca casi un 80% del genoma y se ha obtenido utilizando la plataforma de ultrasecuenciación de la compañía Roche (GS FLX Titanium).

Entre los resultados obtenidos en la investigación se desvela que el melón tiene un genoma de unos 450Mb en sus 12 cromosomas y los primeros datos apuntan a que contiene unos 26.000 genes, un número similar al del genoma humano.

“El melón se escogió por su interés científico al ser una especie con una larga historia genética, para la que han sido descritos caracteres de gran valor en la mejora genética y por su interés económico, ya que su semilla tiene un valor económico elevado. Es un cultivo importante en varias regiones españolas y nuestro país es el primer exportador mundial de melón” afirma Rafael Camacho, director general de la fundación Genoma España.

El proyecto MELONOMICS es un proyecto de 4,1 millones de euros y tres años de duración que comenzó a principios del 2009. Está financiado por la Fundación Genoma España, por cinco Comunidades Autónomas (Andalucía, Castilla-La Mancha, Catalunya, Madrid y Murcia), y cinco empresas privadas (Semillas Fito S.A., Syngenta Seeds S.A., Roche Diagnostics S.A., Savia Biotech S.A. y Sistemas Genómicos S.L.). Tiene una duración de tres años y, además de la secuenciación del genoma de una línea de melón, pretende caracterizar un gran número de variedades de esta especie presentes en los bancos de semillas españoles (incluyendo variedades tradicionales) y aprovechar la variabilidad natural de la especie para generar nuevas variedades de melón con interés agronómico.

"Los principales objetivos de la mejora genética de melón, en el marco del proyecto Melonomics, son identificar variedades resistentes a enfermedades, como por ejemplo, las producidas por hongos, y contribuir a la mejora de la calidad del fruto” afirma Pere Puigdomenech, coordinador científico del proyecto e investigador del Centre de Recerca Agrigenómica (CSIC – IRTA- UAP).

El proyecto está liderado por 14 grupos investigación españoles de Andalucía, Castilla- La Mancha, Catalunya, Madrid, Murcia y Valencia, con instrumental y apoyo informático de la empresa constructora del ultrasecuenciador (Roche 454). A partir de ahora se deberá terminar el ensamblado del genoma, refinar la secuencia utilizando otras técnicas de secuenciación disponibles y anotar los genes. En su estado actual el borrador de la secuencia ya permite comenzar el trabajo a los grupos y empresas implicados de cara al descubrimiento de nuevos genes y marcadores para seleccionar nuevas variedades de interés económico. Al término del proyecto se pondrá al alcance de la comunidad científica internacional un genoma de referencia por su calidad final.

testimonios de la empresa

“El melón se escogió por su interés científico al ser una especie con una larga historia genética, para la que han sido descritos caracteres de gran valor en la mejora genética y por su interés económico, ya que su semilla tiene un valor económico elevado. Es un cultivo importante en varias regiones españolas y nuestro país es el primer exportador mundial de melón” afirma Rafael Camacho, director general de la fundación Genoma España.

"Los principales objetivos de la mejora genética de melón, en el marco del proyecto Melonomics, son identificar variedades resistentes a enfermedades, como por ejemplo, las producidas por hongos, y contribuir a la mejora de la calidad del fruto” afirma Pere Puigdomenech, coordinador científico del proyecto e investigador del Centre de Recerca Agrigenómica (CSIC – IRTA- UAP).

especificaciones técnicas

(*)
• Grupos de Investigación Implicados
Consejo Superior de Investigaciones Científicas , CSIC (3 grupos de 3 institutos diferentes), Centro de Investigación en Agrigenómica CSIC-IRTA-UAB (CRAG)- 1 grupo (personal IBMB-CSIC y del IRTA de Cabrils)-, Universidad Politécnica de Valencia (1 grupo), Universidad de Almería (1 grupo), Universidad Politécnica de Madrid (1 grupo), Fundación Privada de Regulación Genómica (1 grupo), Instituto Madrileño de Investigación y Desarrollo Rural, Agrario y Alimentario (1 grupo)
• Centros financiadores por CCAA
Cataluña: la Dirección General de Investigación del Departamento de Innovación, Universidad y Empresa a través del Institut de Recerca i Tecnología Agroalimentàries (IRTA), empresa pública de la Generalitat de Cataluña. Madrid: a través del Instituto Madrileño de Investigación y Desarrollo Rural, Agrario y Alimentario (IMIDRA). El IMIDRA es un Organismo Autónomo cuyo objetivo fundamental es la investigación y el desarrollo en el mundo agrícola, ganadero y alimentario. Andalucía: a través del Instituto Andaluz de Investigación y Formación Agraria, Pesquera, Alimentaria y de Producción Ecológica (IFAPA). El IFAPA es un instituto de investigación público, y está adscrito a la Consejería de Agricultura y Pesca de la Junta de Andalucía. Murcia: Murcia: a través de la Fundación Séneca, Agencia Regional de Ciencia y Tecnología. Castilla La Mancha: a través de la Consejería de Educación y Ciencia.

informaciones sobre la empresa

Sobre Genoma España
Genoma España es una Fundación estatal pública, para el desarrollo de la investigación genómica y proteómica que lleva a cabo diversas actividades para dinamizar el sector biotecnológico español, actuando como motor y nexo de relación entre la investigación y el mercado. Entre dichas actividades cabe destacar el apoyo directo que Genoma España presta a la investigación en Genómica y Proteómica, financiando grandes proyectos de I+D público-privados y generando plataformas tecnológicas de servicios. Por otro lado, la Fundación promueve la cooperación empresarial, potencia la transferencia de tecnología e impulsa la creación de bioempresas.

contactos

Belén Alonso / Elena de la Cal
Tel: +34 91 770 15 16
e-mail: belena@lewispr.com / elenad@lewispr.com
www.lewispr.es

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